Fiecare document semnat prin Certyneo este marcat cu data și ora conform standardului RFC 3161 de o autoritate terță de marcare a timpului, iar amprenta sa este sigilată în dosarul de dovezi, alături de urmele de audit (identitate, IP, OTP). Data semnării este astfel verificabilă de o terță parte, iar orice modificare a documentului este detectabilă.
Această marcare a timpului RFC 3161 nu este o marcare a timpului calificată. Doar aceasta din urmă, emisă de un furnizor calificat de servicii de încredere (QTSP), beneficiază de prezumția exactității datei și orei prevazute de articolul 41 al eIDAS. Pentru o semnătură calificată (QES), furnizorul calificat aplică propria marcă de timp în PDF.