Механізм спирається на два стовпи: аутентифікація підписувача та цілісність документа.
Для аутентифікації підписувача використовуються один або кілька чинників ідентифікації: надійна адреса електронної пошти (однорразове посилання), код OTP, отриманий через SMS, особистий криптографічний сертифікат тощо. Для гарантування цілісності обчислюється відбиток (хеш) документа на момент підписування. Якщо документ згодом буде змінено, відбиток не збігатиметься — підпис буде зневажений.
У рішеннях як Certyneo процес спирається на бібліотеки обробки PDF, які вбудовують ці криптографічні метадані безпосередньо у файл. Позначена в часі траєкторія аудиту (журнал дій) доповнює механізм, записуючи кожен етап: надсилання, відкриття, підтвердження OTP, підписування тощо.
З технічної точки зору, кілька механізмів безпеки посилюють непорушність процесу: кваліфікована часова мітка (RFC 3161) проставляє сертифіковану часову позначку на кожному підписі; шифрування TLS 1.3 захищає дані під час передачі; геолокалізація та IP-адреса підписавшого записуються для відстеження; нарешті, у деяких процесах (AES/QES) поведінкові біометричні дані (швидкість введення, тиск) доповнюють цифровий відбиток ідентичності.
Концепція неспростовності є центральною: завдяки часовій мітці аудиту та криптографічному підписуванню технічно неможливо для підписавшого заперечити факт підписання документа без підробки ланцюга доказів. Щодо архівування, французька нормативно-правова база (декрет 2016-1673) встановлює зберігання протягом 10 років для більшості комерційних документів — Certyneo забезпечує таке архівування з доказовою цінністю у суверенному розміщенні (ЄС).