Mechanizm opiera się na dwóch filarach: uwierzytelnianiu sygnatariusza i integralności dokumentu.
Do uwierzytelnienia sygnatariusza używa się jednego lub więcej czynników identyfikacji: zaufanego adresu e-mail (jednorazowy link), kodu OTP otrzymanego SMS-em, osobistego certyfikatu kryptograficznego itd. Aby zagwarantować integralność, oblicza się odcisk (hash) dokumentu w momencie podpisu. Jeśli dokument zostanie później zmodyfikowany, odcisk już nie pasuje — podpis jest wówczas unieważniany.
W rozwiązaniach takich jak Certyneo proces opiera się na bibliotekach przetwarzania PDF, które integrują te metadane kryptograficzne bezpośrednio z plikiem. Znakowana czasem ścieżka audytu (dziennik czynności) uzupełnia rozwiązanie, rejestrując każdy etap: wysyłkę, otwarcie, zweryfikowany OTP, podpis itd.
Z technicznego punktu widzenia kilka mechanizmów bezpieczeństwa wzmacnia nienaruszalność procesu: znacznik czasu kwalifikowany (RFC 3161) poświadcza czas na każdym podpisie; szyfrowanie TLS 1.3 chroni dane w tranzycie; geolokalizacja i adres IP podpisującego są rejestrowane dla możliwości śledzenia; wreszcie w niektórych przepływach (AES/QES) dane biometryczne behawioralne (szybkość pisania, nacisk) uzupełniają odcisk tożsamości.
Koncepcja non-repudiacji jest centralna: dzięki dziennikowi audytu opatrzonemu znacznikiem czasu i podpisanemu kryptograficznie, technicznie niemożliwe jest dla podpisującego zaprzeczenie podpisaniu dokumentu bez sfałszowania łańcucha dowodów. W kwestii archiwizacji przepisy francuskie (dekret 2016-1673) nakazują przechowywanie przez 10 lat dla większości aktów handlowych — Certyneo zapewnia tę archiwizację o wartości dowodowej w suwerennym hostingu (UE).