Кожен документ, підписаний через Certyneo, має часову мітку відповідно до стандарту RFC 3161 від третьої сторони — органу часової мітки, а його відбиток запечатується в досьє доказів поряд із журналом аудиту (ідентичність, IP, OTP). Дата підпису таким чином можна перевірити третьою стороною, а будь-яку зміну документа можна виявити.
Ця часова мітка RFC 3161 не є кваліфікованою часовою міткою. Лише остання, видана кваліфікованим постачальником послуг довіри (QTSP), користується презумпцією точності дати та часу, передбаченою статтею 41 eIDAS. Для кваліфікованого підпису (QES) кваліфікований постачальник накладає власну часову мітку в PDF.