DPH 2026: výpočet, hlášení a nové povinnosti pro podniky

DPH zůstává nejsbíranější daní v České republice s přibližně 200 miliardami korun ročních příjmů. V roce 2026 se zavádí několik zásadních změn, které současně upravují pravidla výpočtu, povinnosti hlášení a postupy kontrol. Rozšíření povinné elektronické fakturace, zavedení e-reportingu a úpravy sazeb vycházející z finančního zákona vyžadují od účetních a finančních oddělení včasnou přípravu. Tento článek poskytuje přehled všeho, co potřebujete vědět: daňový základ, aplikované sazby, kalendář hlášení a rizika nedodržení.

Základy výpočtu DPH v roce 2026

Mechanika DPH spočívá na nezměněném principu: podnik vybírá daň jménem státu od svých zákazníků a poté si odečte DPH, kterou sám zaplatil na nákupy. Zůstatek se odvádí státnímu rozpočtu – nebo se vrací, pokud odečitatelná DPH převyšuje vybíranou DPH.

Daňový základ: co se zahrnuje do základu výpočtu

Daňovým základem DPH je cena bez daně z operace zvýšená o všechny vedlejší náklady, které jsou fakturovány: poplatky za dopravu, balení, pojištění, úroky ze zpoždělého placení a dotace přímo související s cenou. Od transpozice evropské směrnice 2006/112/ES do českého práva mohou být srážky za brzkou úhradu udělené v okamžiku vystavení faktury odečteny ze základu, pokud jsou skutečně poskytnuto.

Pozor: pokutami za zpoždění a náhrady škod nejsou předmětem DPH, pokud neremmunují dodání zboží nebo poskytnutí služby.

Sazby DPH aplicované v roce 2026

Česká republika si zachovává v roce 2026 strukturu se čtyřmi sazbami:

• Standardní sazba 21 %: uplatňuje se na převážnou část zboží a služeb, včetně digitálních služeb a služeb SaaS.
• Snížená sazba 15 %: stravovací služby na místě, opravy a údržba, přeprava cestujících, ubytovací služby.
• Nižší snížená sazba 10 %: potraviny první potřeby, knihy, předplatné plynu a elektřiny, vybavení a služby pro osoby se zdravotním postižením, práce na energetické renovaci.
• Zvláštní sazba 5 %: léky hrazené zdravotní pojišťovnou, periodický tisk zapsaný na příslušné komisi.

Finanční zákon na rok 2026 neměnil nominální sazby, ale objasnil podmínky uplatnění snížené sazby 10 % na některé práce na tepelné renovaci, vyžadující předložení certifikátu shody s kritérii energetické účinnosti definovanými vyhláškou č. 2025-421.

DPH na operace v rámci EU

Při výměně zboží v rámci Evropské unie se režim nákupů v rámci EU zakládá na principu určení: DPH se vybírá v zemi příjmu zboží. U služeb B2B je obecné pravidlo založeno na místu, kde je výkonný zákazník usazen, v souladu s článkem 259 Daňového řádu.

Od 1. července 2021 umožňuje jednotné okénko OSS (One Stop Shop) podnikům hlásit a platit DPH ve všech členských státech prostřednictvím jediného rozhraní. V roce 2026 je tento mechanismus plně funkční a jeho používání významně narůstá, zejména pro platformy elektronického obchodu.

Nové povinnosti hlášení DPH v roce 2026

Rok 2026 představuje důležitý bod zlomu v postupech hlášení, způsobený dvěma konvergujícími reformami: rozšířením povinné elektronické fakturace a rozvojem zařízení e-reportingu.

Povinná elektronická fakturace a její vazba na hlášení DPH

Od 1. září 2026 jsou všechny subjekty registrované pro DPH v České republice – včetně malých podnikatelů – povinny přijímat elektronické faktury. Povinné vydávání se aplikuje postupně podle velikosti: velké podniky a střední podniky přešly již v září 2026, malé a mikropodniky budou následovat podle podrobného harmonogramu na stránce harmonogram elektronické fakturace 2026-2027.

Přímým důsledkem pro hlášení DPH je zásadní změna: Finanční správa získává údaje z každé transakce prostřednictvím partnerských portálů pro dematerializaci (PDP) a veřejného portálu fakturace (PPF). Postupem času bude mít správa téměř v reálném čase přehled o toku DPH, což umožní předvyplnění hlášení DPH – podobně jako tomu již je u daně z příjmu.

Chcete-li pochopit přesnou roli těchto portálů v řetězu hlášení, podívejte se na náš průvodce schválenými portály PDP.

E-reporting: nová povinnost podání údajů

E-reporting doplňuje elektronickou fakturaci pokrytím operací, které nepatří do jejího přímého rozsahu: transakce s fyzickými osobami (B2C), výměny s podniky usazenými mimo Českou republiku a operace mimo rámec české DPH.

Konkrétně musí podniky předat finančnímu úřadu agregované údaje o těchto operacích podle pravidelnosti upravené jejich režimem DPH:

• Měsíční režim: podání do 10 dnů po ukončení období.
• Čtvrtletní režim: podání do 10 dnů po skončení čtvrtletí.

Porušení těchto povinností se trestá pokuty dosahující až 15 Kč za chybějící fakturu, nejvýše 15 000 Kč za rok a hlášeného. Podrobný přehled zařízení naleznete v našem článku o e-reportingu a předávání dat transakcí, který podrobně popisuje očekávané formáty souborů a lhůty.

Režimy hlášení a jejich termíny v roce 2026

Volba režimu hlášení závisí na ročním obratu bez DPH:

Zjednodušený režim: dostupný pro podniky, jejichž obrat bez DPH je nižší než 8 400 000 Kč pro obchodní činnost a 2 540 000 Kč pro poskytování služeb. Dvě částečné platby ročně (55 % v červenci, 40 % v prosinci) a roční hlášení podané do 3 měsíců po konci účetního období.

Normální režim: povinný nad prahy zjednodušeného režimu nebo na volbu. Měsíční hlášení, splatné k 19. dni následujícího měsíce pro podniky, u kterých vybíraná DPH za rok převyšuje 40 000 Kč.

Osvobození od DPH: udrženo pro mikropodniky, jejichž obrat bez DPH zůstává nižší než 375 000 Kč za služby a 850 000 Kč za obchod. Tyto prahy byly zvýšeny finančním zákonem na rok 2025 a zůstávají platné v roce 2026.

Dopad reformy na účetnictví a interní procesy

Adaptace informačních systémů

Konvergence mezi elektronickou fakturací, e-reportingem a předvyplněním DPH vyžaduje, aby podniky sladily své nástroje pro řízení. ERP nebo software pro fakturaci, který nevytváří soubory ve formátu Factur-X nebo UBL – strukturované formáty uznávané správou – je nyní kritickým problémem.

Formát Factur-X si zaslouží zvláštní pozornost: jedná se o PDF opatřené vloženým souborem XML, čitelné lidmi a zpracovatelné stroji. Chcete-li ověřit soulad svých faktur, náš bezplatný validátor Factur-X umožňuje okamžitou kontrolu struktury souborů před jejich odesláním.

Správa povinných údajů na fakturách

V roce 2026 byly povinné údaje na fakturách podléhajících české DPH rozšířeny. Kromě tradičních údajů (číslo IČO, identifikační číslo pro DPH, datum splatnosti, aplikovaná sazba, částka bez DPH a s DPH na sazbu) musí elektronické faktury nyní obsahovat:

• IČO příjemce (povinné pro B2B).
• Místo doručení, pokud se liší od adresy příjemce.
• Kategorii transakce (dodání zboží, poskytování služeb, smíšené).
• Číslo nákupní objednávky, je-li uvedeno v dohodě.

Absence některého z těchto údajů může vést k odmítnutí faktury portálem PDP příjemce, což zpožďuje platbu a právo na odečet DPH.

Odečitatelnost DPH: pravidla a omezení

Právo na odečet DPH zůstává předmětem tří kumulativních podmínek: vlastnictví řádné faktury, existence splatnosti DPH u dodavatele a použití zboží nebo služby pro účely zdanitelné činnosti. Vyloučení z práva na odečet kodifikované v článku 206 přílohy II Daňového řádu se týkají zejména:

• Osobních automobilů (s výjimkou pronámu nebo přepravy).
• Nákladů na bydlení vedoucích pracovníků a zaměstnanců.
• Obchodních dárků s jednotkovou hodnotou převyšující 730 Kč bez DPH za rok a příjemce (práh 2026).

Během daňové kontroly má finanční správa od roku 2026 usnadněný přístup k údajům předaným prostřednictvím portálů PDP, což posiluje potřebu dokonalé konzistence mezi vydanými fakturami, přijatými fakturami a hlášenými částkami.

Daňová kontrola a rizika vrácení v roce 2026

Posílená daňová kontrola pomocí dat

Generalizace elektronické fakturace vybavuje správu bezprecedentním kontrolním nástrojem. Prostřednictvím křížení údajů předaných vydavateli a příjemci faktur může finanční správa automaticky identifikovat nesrovnalosti: faktury registrované v nákladech bez vybírané DPH na straně dodavatele, násobné odpisy stejné faktury, sazba nekompatibilní s povahou operace.

Daňové kontroly DPH již představují přibližně 40 % vrácených částek plynoucích z ověření účetnictví. V roce 2026 účetní odborníci očekávají intenzifikaci cílených kontrol generovaných algoritmicky, podobných těm, které se v Nizozemsku či Španělsku používají už několik let.

Hlavní rizika vrácení

Nejčastější důvody vrácení DPH jsou:

1. Nesprávná sazba: uplatnění snížené sazby na operaci se standardní sazbou, zejména u stavebních prací nebo stravování s sebou.
2. Špatně identifikovaný vznik daňové povinnosti: zmatení mezi datem dodání a datem faktury u dodávky zboží, nebo mezi příjmem platby a datem faktury u služeb podléhajících DPH na výběr.
3. Opomenutí DPH na naturální benefity nebo operace mezi společnostmi stejné skupiny.
4. Neoprávněné odpisy na faktury, které nerespektují povinné údaje nebo pocházejí od dodavatelů v nepravidelné situaci.

Pro podniky zapojené do složitých operací (intrakomunitární, autoliquidation, speciální režimy) se osvědčuje předběžný audit souladu s ohledem na hrozící pokuty: příplatek 40 % v případě úmyslného porušení, 80 % v případě podvodných praktik, mimo úroky ze zpoždění 0,20 % měsíčně.

Propojení mezi elektronickým podpisem a daňovým soulubem je přímé: faktorura podepsaná elektronicky podle norem eIDAS zaručuje autenticitu původu a integritu obsahu, dvě ze tří podmínek kladených směrnicí DPH pro odečitatelnost. Bližší informace naleznete v našem komplexním průvodci elektronickou fakturací 2026-2027, který představuje celý soubor právních předpisů.

Právní rámec platný pro DPH a elektronickou fakturaci v roce 2026

Česká DPH se odehrává v právním rámci na několika úrovních – evropské a národní – jehož zvládnutí podmíňuje platnost odečtů a odolnost vůči kontrolám.

Směrnice DPH 2006/112/ES: zakladatelský text harmonizující pravidla DPH v rámci Evropské unie. Stanovuje zásady základu, minimálních sazeb (5 % pro sníženou sazbu, 15 % pro standardní), odečitatelnosti a vzniku daňové povinnosti. Každé národní pravidlo se jí musí podřídit.

Daňový řád: články 56 až 93 organizují česká pravidla DPH. Článek 89 definuje povinné údaje na fakturách. Články 71 až 73 upravují právo na odečet. Článek 83 stanovuje pravidla autoliquidation.

Nařízení č. 2021-1190 ze 15. září 2021: týkající se generalizace elektronické fakturace v transakcích B2B. Změněno finančním zákonem na rok 2024, stanovuje harmonogram nasazení ve vlnách a povinnosti e-reportingu.

Vyhláška č. 2022-1299 ze 7. října 2022: upřesňuje technické formáty elektronických faktur (Factur-X, UBL, CII) a minimální data požadovaná pro e-reporting.

Nařízení eIDAS č. 910/2014 Evropského parlamentu a Rady: zakládá právní rámec pro kvalifikovaný elektronický podpis, jehož důkazní hodnota je v celé EU rovnocenná ručnímu podpisu (článek 25). Kvalifikovaný elektronický podpis kladený na fakturu splňuje požadavek autenticity původu položený směrnicí DPH, pokud je vydán zprostředkovatelem kvalifikovaných služeb důvěry (QTSP) uvedeným na seznamu důvěry.

GDPR č. 2016/679: přenos fakturačních údajů mezi podniky a vůči finančnímu úřadu zahrnuje zpracování osobních údajů (jména, kontakty). Správce ochrany osobních údajů (DPO) by měl být zapojen do projektů dosažení souladu s elektronickou fakturací.

Směrnice NIS2 (2022/2555/EU): transpozicí v českou právní soustavu zákonem č. 2023-703 se zavádějí posílené požadavky na bezpečnost pro operátory základních služeb a poskytovatele digitálních služeb, včetně PDP. Podniky, které externalizují svůj fakturační tok prostřednictvím PDP, si musí smluvně zajistit, že tato splňuje povinnosti NIS2.

Normy ETSI EN 319 132 a EN 319 122: technicky upravují pokročilé (XAdES) a kvalifikované elektronické podpisy používané k časovému razítku a zabezpečení elektronických faktur. Dodržení těchto norem podmíňuje přijatelnost důkazů v případě sporu nebo daňové kontroly.

Scénáře použití: jak si podniky přizpůsobují pravidla DPH 2026

Malý podnik v IT službách čelící e-reportingu

Malý podnik s přibližně šedesáti zaměstnanci, specializující se na správu IT a vývoj aplikací, realizuje přibližně 30 % svého obratu se zákazníky usazenými mimo Českou republiku (podniky v Evropě a soukromí zákazníci). Tyto toky – nekryté povinnou elektronickou fakturací B2B v národě – spadají do rozsahu e-reportingu od 1. září 2026.

Po třítýdenním interním auditu oddělení účetnictví zjistí, že jeho ERP generuje CSV exporty, které nejsou v souladu s technickými specifikacemi finanční správy. Aktualizace konektoru PDP a školení dvou kolegů představují investici přibližně 80 000 Kč. Na oplátku automatické sladění deklarovaných a přijatých údajů zkrátí čas přípravy měsíčního hlášení DPH ze 6 hodin na méně než 1 hodinu, což znamená úsporu přibližně 35 000 Kč ročně v čase účetního.

Daňové poradenské oddělení spravující klienty v různých režimech

Daňové poradenské oddělení s 25 zaměstnanci doprovází smíšenou klientelu: obchodníky v zjednodušeném režimu, svobodná povolání osvobozeného od DPH a průmyslové společnosti v normálním režimu. V roce 2026 musí oddělení současně spravovat tři deklarativní logiky a zajistit, aby se každý klient v patřičný čas přesunul na povinné přijímání elektronických faktur.

Oddělení přijme centralizované řešení pro správu toků elektronických faktur připojené k jeho platformě pro správu spisu. U klientů osvobozeného od DPH zdokumentuje povinnost přijímání, i bez povinnosti vydávání – často nepochopený bod. Celoživostní soulad umožňuje vyjednat skupinové ceny u schváleného portálu PDP, čímž se jednotkové náklady na klienta sníží o 35 % oproti jednotlivým předplatným.

Distributor B2B čelící sladění DPH v rámci EU

Distributor průmyslového vybavení realizující 180 milionů Kč obratu bez DPH ročně provádí nákupy v rámci EU od dodavatelů z Německa, Itálie a Polska a dodá zboží zákazníkům v Belgii a Nizozemsku. V roce 2026 generalizace elektronického reportingu v těchto partnerských zemích vytváří riziko dvojího hlášení, není-li předávaný údaj správám v jednotlivých zemích konzistentní.

Zavedením vyhrazeného modulu pro operace v rámci EU v systému správy podniku automatizuje ověřování intrakomunitárních čísel DPH prostřednictvím služby VIES Evropské komise, kontrolu souladu čísel DPH partnerů a automatickou generaci rekapitulačních přehledů. Tato automatizace snižuje deklarativní anomálie téměř o 70 % během prvních šesti měsíců provozu, podle sledování realizovaného vedením oddělení.

Často kladené otázky

Jak vypočítat DPH na vrácení za dané období?

DPH na vrácení je rovna DPH vybírané (obrat bez DPH prodejů vynásobený aplikovanou sazbou) snížené o odečitatelnou DPH (DPH uvedená na fakturách za odborné nákupy). Pokud vybíraná DPH převyšuje odečitatelnou DPH, podnik vrátí zůstatek správě. Pokud odečitatelná DPH převyšuje, může požádat o vrácení nebo převést kredit na následující období.

Jaký je rozdíl mezi DPH na výběr a DPH na inkaso?

DPH na výběr vzniká vydáním faktury, bez ohledu na skutečnou platbu. Jedná se o režim de lege. DPH na inkaso, použitelná u poskytování služeb (není-li voleno opačně), vzniká při skutečném přijetí platby. Tato volba má významný dopad na likviditu, zvlášť v případě dlouhých lhůt placení.

Kterých podniků se týká e-reporting v roce 2026?

Všechny subjekty registrované pro DPH v České republice se týkají e-reportingu od té doby, co provádějí operace, které nejsou pokryty povinnou elektronickou fakturací B2B: prodej fyzickým osobám, transakce s podniky usazenými mimo Českou republiku nebo operace osvobozené od DPH. Mikropodniky osvobozeného od DPH neshromažďují DPH, ale zůstávají zavázány určitými povinnostmi předání, překročí-li přechodné prahy.

Je osvobození od DPH upraveno v roce 2026?

Ne. Prahy osvobození od DPH установlenные finančním zákonem na rok 2025 zůstávají nezměněny v roce 2026: 850 000 Kč bez DPH pro prodej a poskytování ubytování, 375 000 Kč bez DPH pro poskytování služeb. Podniky osvobozeného si mohou ponechat statut do 935 000 Kč respektive 412 500 Kč. Neshromažďují DPH, ale jsou povinny přijímat elektronické faktury od září 2026.

Jak elektronický podpis zaručuje odečitatelnost DPH na faktuře?

Podle směrnice DPH 2006/112/ES musí faktorura zaručit autenticitu svého původu a integritu svého obsahu, aby otvírala nárok na odečet. Kvalifikovaný elektronický podpis podle nařízení eIDAS č. 910/2014 splňuje obě požadavky: jednoznačně identifikuje vydavatele a detekuje jakoukoliv následnou změnu dokumentu. V případě daňové kontroly je faktorura podepsaná elektronicky s kvalifikovaným certifikátem silným důkazem, který správa nemůže zpochybnit.

Závěr

DPH 2026 není pouhá aktualizace právních předpisů: jedná se o hlubokou přestavbu postupů výpočtu, hlášení a kontroly, kterou podporuje konvergence mezi povinnou elektronickou fakturací a e-reportingem. Podniky, které si tyto změny předem připraví – přizpůsobením svých informačních systémů, zabezpečením souladu svých faktur a školením týmů – transformují regulační povinnost v provozní výhodu.

Certyneo doprovází podniky v této tranzici: od kvalifikovaného elektronického podpisu vašich faktur až po správu dokumentárních toků v souladu s požadavky finanční správy. Zjistěte, jak naše řešení může zjednoduší vaši realizaci souladu a snížit vaší administrativní zátěž tím, že si vyžádáte osobní prezentaci nebo prozkoumáte naše ceny přizpůsobené každé velikosti podniku.