Cơ chế dựa trên hai trụ cột: xác thực người ký và tính toàn vẹn của tài liệu.
Để xác thực người ký, sử dụng một hoặc nhiều yếu tố nhận dạng: địa chỉ email đáng tin cậy (liên kết dùng một lần), mã OTP nhận qua SMS, chứng chỉ mật mã cá nhân, v.v. Để đảm bảo tính toàn vẹn, người ta tính dấu vết (hash) của tài liệu tại thời điểm ký. Nếu tài liệu bị sửa đổi sau đó, dấu vết không còn khớp — chữ ký bị vô hiệu.
Trong các giải pháp như Certyneo, quy trình dựa vào các thư viện xử lý PDF tích hợp siêu dữ liệu mật mã này trực tiếp vào tệp. Một audit trail có dấu thời gian (nhật ký hành động) bổ sung cho hệ thống bằng cách ghi lại mỗi bước: gửi, mở, OTP được xác thực, ký, v.v.
Về mặt kỹ thuật, nhiều cơ chế bảo mật được áp dụng để tăng cường tính bất khả xâm phạm của quy trình: dấu thời gian qualifié (RFC 3161) ghi lại bằng chứng thời gian được xác nhận trên mỗi chữ ký; mã hóa TLS 1.3 bảo vệ dữ liệu trong quá trình truyền; định vị địa lý và địa chỉ IP của người ký được ghi lại để theo dõi; cuối cùng, trong một số luồng (AES/QES), dữ liệu sinh trắc học hành vi (tốc độ gõ, áp lực) được bổ sung cho dấu vân tay định danh.
Khái niệm không thể chối cãi là trung tâm: nhờ vào audit trail được horodatage và ký kỹ thuật số, về mặt kỹ thuật không thể cho người ký phủ nhận rằng họ đã ký một tài liệu mà không làm giả chuỗi bằng chứng. Về lưu trữ, quy định pháp luật Pháp (sắc lệnh 2016-1673) yêu cầu lưu trữ trong 10 năm cho hầu hết các tài liệu thương mại — Certyneo đảm bảo lưu trữ này với giá trị chứng cứ trong môi trường lưu trữ độc lập (EU).